Xenorhabdus nematophila發(fā)酵動力學(xué)研究
- 期刊名字:生物數(shù)學(xué)學(xué)報(bào)
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- 論文作者:王永宏,張興
- 作者單位:西北農(nóng)林科技大學(xué)無公害農(nóng)藥研究服務(wù)中心
- 更新時(shí)間:2020-08-31
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生物數(shù)學(xué)學(xué)報(bào)2007,22(2):243-250 BiomathematicsXenorhabdus nematophila發(fā)酵動力學(xué)研究王永宏張興(西北農(nóng)林科技大學(xué)無公害農(nóng)藥研究服務(wù)中心,陜西楊陵712100)摘要:在分批發(fā)酵中,研究了 Xenorhabdus nematophila YL001的生長、基質(zhì)消耗及抗菌物質(zhì)產(chǎn)生的特性,基于 Logistic方程和 Luedeking- Piret方程,得到了描述分批發(fā)酵過程的動力學(xué)模型及模型參數(shù),同時(shí)對實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)與模型進(jìn)行了驗(yàn)證比較.模型計(jì)算值與實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)擬合良好,模型基本反映了 Xenorhabdus nematophila yL001分批發(fā)酵過程的動力學(xué)特征.分批發(fā)酵中細(xì)胞生長與產(chǎn)物合成屬于偶聯(lián)型關(guān)鍵詞: Xenorhabdus nematophila;發(fā)酵動力學(xué);數(shù)學(xué)模型中圖分類號:TQ92MR分類號:92C40;92C45文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A文章編號:1001-9626(2007)02-0243080引言Xenorhabdus屬細(xì)菌與昆蟲病原線蟲 Steinernema共生,屬腸桿菌科叫.線蟲攜帶共生菌通過氣孔、肛門、節(jié)間膜等自然孔口進(jìn)入昆蟲體內(nèi),將共生菌釋放到昆蟲的血腔中,共生菌在其中大量繁殖,產(chǎn)生毒素和抑菌物質(zhì),使昆蟲患敗血癥,一般在48小時(shí)內(nèi)死亡.共生菌具有多種生物學(xué)功能,在昆蟲病原線蟲的大規(guī)模生產(chǎn)中,共生菌不僅可直接作為線蟲的營養(yǎng)源,而且可分解寄主組織和培養(yǎng)介質(zhì),為線蟲的生長、繁殖提供營養(yǎng);共生菌的次生代謝產(chǎn)物具有抑菌2,、殺蟲國、殺線蟲和抗腫瘤間等多種活性;在醫(yī)療衛(wèi)生和農(nóng)業(yè)領(lǐng)域具有較大的應(yīng)用前景和商業(yè)潛力微生物反應(yīng)動力學(xué)包括細(xì)胞生長動力學(xué)、基質(zhì)消耗動力學(xué)和代謝產(chǎn)物生成動力學(xué).通過發(fā)酵動力學(xué)的研究和發(fā)酵模型的建立,能更好的認(rèn)識微生物發(fā)酵過程中菌體的生長和產(chǎn)物形成的機(jī)制,以及影響這些機(jī)制的一些重要環(huán)境因素,最終實(shí)現(xiàn)發(fā)酵過程的有效控制,達(dá)到提高產(chǎn)物發(fā)酵指標(biāo)的目的.本文對X. nematophila Yl001的發(fā)酵動力學(xué)進(jìn)行了研究,并對動力學(xué)方程進(jìn)行了模擬1材料與方法11試驗(yàn)材料(1)供試共生細(xì)菌收稿日期:200603-27中國煤化工基金項(xiàng)目:國家863項(xiàng)目“昆蟲病原線蟲共生菌殺蟲、殺菌劑的CN MH GAA241140)作者筒介:王永宏(1968-),男,陜西鳳翔縣人,副教授,博士. E-mail: hwang68@126com*通訊作者生物數(shù)學(xué)學(xué)報(bào)第22卷昆蟲病原線蟲共生菌X. nematophila YLool從其寄主線蟲 Steinernema sp中分離鑒定獲得(2)指示菌蠟狀芽孢桿菌 Bacillus cereus由西北農(nóng)林科技大學(xué)無公害農(nóng)藥研究服務(wù)中心提供(3)培養(yǎng)基斜面及平板培養(yǎng)基:NA培養(yǎng)基,牛肉膏3.0g、蛋白胨50g、營養(yǎng)瓊脂20g、水1000ml、pH72~74;共生菌鑒別培養(yǎng)基:NBTA培養(yǎng)基,NA+(TTC0.04g、BTB0.025g);發(fā)酵培養(yǎng)基:葡萄糖6.13g/L、蛋白胨21.29g/L、MgSO41.50g/L、(NH4)2SO4246g/L、KH2PO40.86g/L、K2HPO41.1g/L、Na2SO41.72g/L、水1000ml,pH72~74.12試驗(yàn)方法(1)共生菌的培養(yǎng)種子培養(yǎng):將種管保存的X. nematophila yl001,劃線于NA培養(yǎng)基平板上活化,28°C培養(yǎng)24~48h,從生長良好的活化平板上挑取單菌落,再劃線于NBTA培養(yǎng)基平板上,28°C培養(yǎng)24~48h,觀察菌落的顏色變化,區(qū)分初生型和次生型共生菌.菌落為藍(lán)色,周圍培養(yǎng)基中的染料被吸收變?yōu)辄S色的為初生型;菌落為紅色,周圍培養(yǎng)基中的染料不被吸收而保持藍(lán)色的為次生型.用接種環(huán)挑取初生型菌,接種于搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)基中,28C、180r/min振蕩培養(yǎng)16h發(fā)酵罐培養(yǎng):使用鎮(zhèn)江東方生物工程設(shè)備技術(shù)公司生產(chǎn)的GUJS-7B型L全自動控制發(fā)酵罐進(jìn)行分批發(fā)酵.發(fā)酵罐容積江L,兩層六平直葉攪拌,三擋板.裝料系數(shù)07,接種量9%,發(fā)酵溫度26~28°C,通氣量25L/min,攪拌轉(zhuǎn)速300rpm,發(fā)酵過程中流加泡敵消泡(2)發(fā)酵過程參數(shù)檢測OD的測定:取不同時(shí)期的培養(yǎng)液,用分光光度計(jì)在600m測定發(fā)酵液OD值DCW的測定:在一定的細(xì)胞濃度范圍內(nèi),光密度與細(xì)胞濃度成正比,因而通過建立光密度與細(xì)胞干重的直線回歸方程來測定發(fā)酵過程中的細(xì)胞干重(DCW)pH測定:由pH電極在線測定發(fā)酵過程中的pHDO測定:復(fù)膜氧電極在線測定發(fā)酵過程中的溶解氧DO還原糖測定:采用3,5二硝基水楊酸法(DNS)測定培養(yǎng)過程中還原糖的變化動態(tài)氨基氮測定:采用甲醛滴定法測定培養(yǎng)過程中氨基氮的變化動態(tài)抑菌活性測定:用管碟法測定X. nematophila YL001的抑菌活性.將熔化的NA培養(yǎng)基冷卻至45°C~50°C,加入指示菌(1.5%V/V)搖均,每皿(d=9.0cm)倒入15ml培養(yǎng)基,制好平板后,用打孔器(直徑75mm)在平板上均勻的打三個(gè)孔,每孔內(nèi)加入1004l共生菌發(fā)酵液無菌濾液,以培養(yǎng)基為對照,在28°C培養(yǎng)24h,測量抑菌圈直徑x. mematophilaYl001抑菌活性單位定義:在上述測定條件下,1004發(fā)酵濾液抑菌圈直徑為105mm時(shí)定義為1個(gè)活性單位(U),即此發(fā)酵液活性為1m1成1m00/(3)數(shù)據(jù)處理方法中國煤化工模型參數(shù)的優(yōu)化及方程組的求解均利用DPS軟亻CNMHG第2期王永宏等: Xenorhabdus nematophila發(fā)酵動力學(xué)研究2結(jié)果與分析21江L發(fā)酵罐中X. nematophila YL001的分批發(fā)酵分批發(fā)酵的實(shí)驗(yàn)結(jié)果見圖1.由圖可以看出YL001菌株的細(xì)胞生長曲線比較明顯.0~6h為生*太義半1長遲滯期,063)0為指數(shù)生長期,細(xì)胞生長在30達(dá)到穩(wěn)定生長期,此后細(xì)胞生長量基本維持不變,DCW57h達(dá)到最大,為1958g/L.從抑菌物質(zhì)活性單位變還原糖14X-PH化曲線圖可以看出,其變化過程與生物量的變化趨勢非常接近,抑菌物質(zhì)活性單位在48h達(dá)到最大,為06121824303642485460667223.2U/ml,此后抑菌物質(zhì)的活性單位下降較慢,保持圖1x. nematophila yloc的分批發(fā)酵曲線在較高水平.從葡萄糖消耗曲線可看出,葡萄糖的利用基本上與細(xì)胞生長呈影鏡關(guān)系,而從生長曲線與活性單位曲線的關(guān)系可以反應(yīng)出抑菌物質(zhì)的產(chǎn)生伴隨著細(xì)胞的生長,因此預(yù)計(jì)Xnematophila YL001生產(chǎn)抑菌物質(zhì)的發(fā)酵類型可能屬于生長關(guān)聯(lián)型.22動力學(xué)模型的建立(1)生長動力學(xué)描述菌體生長最常用的模型為 Monod方程,該模型為典型的決定論均非結(jié)構(gòu)模型,而且最簡單.它是基于以下假設(shè)建立的:(1)菌體生長為均衡型非結(jié)構(gòu)式生長,細(xì)胞成分只需要用個(gè)參數(shù)即菌體濃度表示即可;(2)培養(yǎng)基中只有一種底物是生長限制性底物,其它營養(yǎng)成分不影響微生物生長;(3)將微生物生長視為簡單反應(yīng),并假設(shè)菌體得率為常數(shù),沒有動態(tài)滯后0.10.顯然(2)、(3)不符合共生菌發(fā)酵的特征,采用 Monod方程有偏差.結(jié)合菌體生長的特性圖1)和多批次發(fā)酵結(jié)果,發(fā)現(xiàn)該菌在發(fā)酵過程中,在一定發(fā)酵條件下,菌體的生長有一最大濃度. Logistic方程可以很好地解釋這一現(xiàn)象Logistic模型是一個(gè)典型的S型曲線,能很好地反映分批發(fā)酵過程中因菌體濃度的增加對自身生長存在的抑制作用,能較好地?cái)M合分批發(fā)酵過程的菌體生長規(guī)律dt Amax/I-rdXX(1式中,max:最大比生長速率(h-1);X:菌體濃度(g/L);t:時(shí)間(h),當(dāng)t=to時(shí),X=X0,將(l)式積分得:2)產(chǎn)物生成動力學(xué)模型微生物產(chǎn)物形成過程非常復(fù)雜,為便于研究,d之間的關(guān)系,將其分為三種類型:(1)相關(guān)模型,是H中國煤化工與細(xì)胞生長速率CNMHG長相關(guān)的過程,此時(shí)產(chǎn)物通常是基質(zhì)的分解代謝產(chǎn)物,代謝產(chǎn)物的生成與細(xì)胞的生長是同步的;(2)部分相關(guān)246生物數(shù)學(xué)學(xué)報(bào)第22卷模型,該類反應(yīng)的生成與基質(zhì)消耗僅有間接的關(guān)系,在細(xì)胞生長期內(nèi),基本無產(chǎn)物生成;(3)非相關(guān)模型,產(chǎn)物的生成與細(xì)胞的生長無直接聯(lián)系,它的特點(diǎn)是當(dāng)細(xì)胞處于生長階段時(shí),并無產(chǎn)物積累,當(dāng)細(xì)胞生長停止時(shí),產(chǎn)物卻大量生成dPdx⊥3x式(3)為 Luedekin-Piret's方程,式中a≠0、B=0可表示I類發(fā)酵;a≠0、≠0可表示Ⅱ類發(fā)酵;a=0、≠0可表示Ⅲ類發(fā)酵,由于 Piret's方程既能反映出伴隨著菌體生長產(chǎn)物的形成速度,也能反映出獨(dú)立于菌體之外,細(xì)胞催化底物形成產(chǎn)物的速度.因此, Piret'方程原則上均適用于一般的發(fā)酵過程通過共生菌發(fā)酵過程分析及特征(1)可以看出,抑菌物質(zhì)的產(chǎn)生與菌體生長有直接相關(guān)性,即產(chǎn)物的生成與底物的消耗是直接的關(guān)系.為了進(jìn)一步驗(yàn)證產(chǎn)物形成與菌體生長的關(guān)系,對相關(guān)模型和部分相關(guān)模型均進(jìn)行了分析(1)部分相關(guān)模型dp dX+BX穩(wěn)態(tài)時(shí),dX=0,x=xnm,則上式可變?yōu)?以t=0時(shí)P=0為初始條件,將式(4)代入式(3),積分后得:P=aXoIn(1-em-ekmaxpma式(⑤5)可寫成如下形式:P=aA(t)+BB(t)其中,A(t)=Xo(1umaxXB(t)XAmaxl(1-xm(1-c)式(6)中B可由式(4)得到,mar、Xmax、X0均已知,以(P-BB(t)對A(t)作圖,直線斜率即為a值根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,接種后0~36h是菌體生長期,36~72h是抑菌物質(zhì)穩(wěn)定合成期(圖1)當(dāng)菌體生長處于穩(wěn)定期時(shí),dX/t=0,X=Xmax中國煤化工,取抑菌物質(zhì)穩(wěn)定合成期抑菌物質(zhì)的活性單位P對時(shí)間t作圖,利CNMH得到兩者關(guān)系為:P=24436-0.025833,相關(guān)系數(shù)R=0505抑函砌質(zhì)根足臺城期御圖物質(zhì)的活性單位P與時(shí)間t無線性相關(guān)關(guān)系.因此,不宜用部分相關(guān)模型表示抑菌物質(zhì)的形成規(guī)律第2期王永宏等: Xenorhabdus nematophila發(fā)酵動力學(xué)研究247(2)相關(guān)模型在相關(guān)模型中產(chǎn)物生成速率與菌體生長速率成線性關(guān)系:d dx對式(7)積分可得產(chǎn)物生成動力學(xué)模型P= Po+a(X-Xo將式(2)代入式(8)可得XP=a根據(jù)相關(guān)模型方程(9),以產(chǎn)物生成速率dP/對菌體生長速率dx/t進(jìn)行線性擬合,得到兩者關(guān)系為:P=0.168783+2.0028,相關(guān)系數(shù)R=0.9072,由此可見,利用相關(guān)模型方程(⑨)對整個(gè)發(fā)酵過程產(chǎn)物生成數(shù)據(jù)擬合偏差較小,該模型適合用于表示抑菌物質(zhì)生成規(guī)律分析過程也進(jìn)一步驗(yàn)證了圖1中關(guān)于X. nematophila YL001生產(chǎn)抑菌物質(zhì)的發(fā)酵類型可能屬于生長關(guān)聯(lián)型的推論(3)基質(zhì)消耗動力學(xué)模型在YL001菌株的發(fā)酵過程中,基質(zhì)(葡萄糖)的消耗主要用于:(1)構(gòu)成菌體成分;(2)維持菌體生長和代謝的需要;(3)合成抑菌物質(zhì).因此,基質(zhì)消耗的方程可表示為:dsdsdtdtdt即ds1 dXdt1 dP+mX(10式中S為基質(zhì)濃度(g/L),X為細(xì)胞濃度(g/L),P為抑菌物質(zhì)活性單位U/m),m為細(xì)胞的維持系數(shù)(1),Yx/s為菌體相對于基質(zhì)的得率系數(shù)(g/g),YP/s為抑菌物質(zhì)活性單位相對于基質(zhì)的得率系數(shù)(g/g)將式(7)代入式(10)后得dsdXXdtYxISdt(11)P/S式(11)可簡化為:dsdXdt(12)中國煤化工其中,CNMHG248生物數(shù)學(xué)學(xué)報(bào)第22卷6P/S穩(wěn)態(tài)時(shí)=0,X=Xmax,由式(12)得:a})將式(2)代入式(13)后積分得S=So-YXomaxIn(1Amax式(1)、(7)、(12)構(gòu)成了X. nematophila YL001發(fā)酵過程中菌體生長、抗菌物質(zhì)形成及基質(zhì)消耗的動力學(xué)模型,式(2)、(9)、(14)分別為3個(gè)模型的積分形式以上各式描述了發(fā)酵過程中X. nematophila YL001菌體生長及抗菌活性單位的變化規(guī)律.23模型求解將上述模型根據(jù)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)在計(jì)算機(jī)上模擬求解,得到模型中的各個(gè)參數(shù)及初始條件見表因此,菌體生長動力學(xué)模型為:dXds0.1361×(1X18.50733抗菌物質(zhì)產(chǎn)生動力學(xué)模型為.dP=2.0028×ddXdtdX基質(zhì)消耗動力學(xué)模型為:-d:=039838×d+043x表1動力學(xué)模型參數(shù)Table 1 Parameter values in the kinetic models for Xenorhabdus nematophila batch fermentationParametersCalculated data1.83406/Lg/L0.131612.0028U/g細(xì)胞0.00443g葡萄糖/(g細(xì)胞.b)0318987g葡萄糖/(g細(xì)胞)2.4模型的驗(yàn)證在已知實(shí)驗(yàn)條件下,進(jìn)行分批發(fā)酵的重復(fù)實(shí)驗(yàn),中國煤化工合成及底物消耗的變化曲線,并對分批發(fā)酵的實(shí)驗(yàn)值與各動力學(xué)模CNMH如圖2,3,4的結(jié)果第2期王永宏等: Xenorhabdus nematophila發(fā)酵動力學(xué)研究≥實(shí)驗(yàn)值實(shí)驗(yàn)值擬合值00612182430364248546066720122436486072圖2菌體生長的發(fā)酵實(shí)驗(yàn)值與模型計(jì)算值的比較圖3抑菌物質(zhì)活性單位的實(shí)驗(yàn)值與模型計(jì)算值的比較從圖可以看出,細(xì)胞生長的實(shí)驗(yàn)值與模型擬合結(jié)果能較好地吻合;在產(chǎn)物合成的擬合中,模型僅能6基本描述抑菌物質(zhì)的產(chǎn)生過程.在發(fā)酵前3h能較好5◆實(shí)驗(yàn)值擬合值地?cái)M合模型抑菌物質(zhì)的實(shí)際產(chǎn)生過程.但在36h后實(shí)驗(yàn)值出現(xiàn)了急劇的降低,其原因可能是:抑菌物質(zhì)言2是由多種成分組成,且發(fā)酵是一個(gè)非常復(fù)雜的過程,在抑菌物質(zhì)生產(chǎn)過程中不僅有合成還有分解,尤其是3648當(dāng)外界環(huán)境條件不利于抑菌物質(zhì)穩(wěn)定時(shí),因此,在圖4葡萄糖消耗的橫型值與實(shí)驗(yàn)值的比較描述抑菌物質(zhì)的產(chǎn)生時(shí)不能單純地只考慮細(xì)胞生物量的情況,還必須考慮抑菌物質(zhì)的組成成分、菌體的自溶和不利的外界條件等對產(chǎn)物分泌的影響;對于底物碳源消耗的擬合過程,在發(fā)酵前30h過程中,經(jīng)計(jì)算該模型方程與實(shí)驗(yàn)值偏差在15%以上,在發(fā)酵30h后模型能夠很好地描述實(shí)驗(yàn)值3討論通過X. nematophila Y001發(fā)酵動力學(xué)的研究,擬和出其細(xì)胞生長、產(chǎn)物形成及基質(zhì)消耗的動力學(xué)方程,能基本反映YL001菌株的發(fā)酵過程微生物反應(yīng)過程非常復(fù)雜,該過程既包括細(xì)胞內(nèi)的生化反應(yīng),也包括胞內(nèi)與胞外的物質(zhì)交換,還包括胞外的物質(zhì)傳遞過程.要對這樣一個(gè)復(fù)雜的體系進(jìn)行精確的描述幾乎是不可能的特別是在分批發(fā)酵過程中建立機(jī)制模型幾乎是不可能.為了工程上的應(yīng)用,首先要進(jìn)行合理的簡化,從模型的簡化考慮一般釆用均衡生長的非結(jié)構(gòu)模型,即在細(xì)胞的生長過程中,細(xì)胞內(nèi)各種成分均以相同的比例增加,視菌體為單組份,不考慮環(huán)境對菌體組成的影響101.本文建立的模型均基于均衡生長的非結(jié)構(gòu)模型假設(shè)目前,國內(nèi)外生化工程學(xué)者所構(gòu)建的模型大多屬于數(shù)學(xué)擬合模型和正規(guī)模型,數(shù)學(xué)擬合模型應(yīng)用最為廣泛.其中,數(shù)學(xué)擬合模型建模較為簡便,便于分析驗(yàn)證,易實(shí)現(xiàn)計(jì)算自動化.這些模型從本質(zhì)上講是對分批發(fā)酵過程總體現(xiàn)象和行為的描述,是一種現(xiàn)象模型.從工程角度出發(fā),建立模型是為了更深刻地了解微生物復(fù)雜的反中國煤化工到,建立最優(yōu)的操作條件,并為反應(yīng)器的優(yōu)化和控制服務(wù).一個(gè)好的現(xiàn)NMHG正:(1)模型能夠定量的描述發(fā)酵過程的變化;(2)主要影響因子的作用能夠在模型甲反映出來.本研究所建250生物數(shù)學(xué)學(xué)報(bào)第22卷立的動力學(xué)模型基本具備以上兩個(gè)特征,能較好的描述X. nematophila Y001發(fā)酵過程的變化,特別是細(xì)胞生長模型,但產(chǎn)物生成和基質(zhì)消耗的動力學(xué)方程的模型預(yù)測值與實(shí)驗(yàn)值有一定的偏離,這可能是由多種原因造成的,如抑菌物質(zhì)的組成成分、菌體的自溶和不利的外界條件等對產(chǎn)物分泌的影響等.因此需要在以后的研究中根據(jù)抑菌物質(zhì)的合成、基質(zhì)的消耗規(guī)律不斷去修正所建立的動力學(xué)模型參考文獻(xiàn)(1 G M, Poinar G O. 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International Journal of Systematic Bacteriology, 1983, 33(1): 38-45]陳毓莖.生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)方法和技術(shù)[M]北京,科學(xué)出版社,2002,97-1919陳堅(jiān),李寅,發(fā)酵過程優(yōu)化原理與實(shí)踐M!北京:化學(xué)工業(yè)出版社,2001,2838.10戚以政,汪叔雄。生化反應(yīng)動力學(xué)與反應(yīng)器[M]北京;化學(xué)工業(yè)出版社,1996,117-178金志華,林建平芩沛霖替考游戲放線菌發(fā)酵生產(chǎn)替考拉寧的動力學(xué)模型門J生物數(shù)學(xué)學(xué)報(bào),2004,19(1):103-108Kinetic Study of Batch Fermentation of Xenorhabdus nematophilaWANG Yong-hong ZHANG Xing(Biorational Pesticides Research and Service Center, Northwest SciTech University of Agriculture and Forestry, Y angling Shanti 712100 china)Abstract: The fermentation process of Xenorhabdus nematophila YL001 was studied ina 7 L batch system, and a kinetic model was proposed based on the Logistic and LuedekingPiret equations for microorganism growth, product formation and substrate consumption. Withthe evaluated model parameters, the model appears to provide a reasonable description for thefermentation process. The antibiotics formation is gronLatch cultures withXenorhabdus nematophila YL001中國煤化工Key words: Xenorhabdus nematophila; FermeCN Gematical models
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